我们之前曾经提到过“三域系统”。

1977年时（三域无根树），探索着生命起源奥秘的美国微生物学家和生物物理学家卡尔·理查德·乌斯（Carl·Richard·Woese）等人提出细胞生命形式分类，将原核生物分成了两大类。

也就是真细菌和古细菌。

卡尔·乌斯和团队里的学者们在总结了对微生物rRNA序列的研究后，认为这两类生物，和真核生物具有基因上的共通性和差异性，判断古菌、细菌和真核生物其实有共同的进化祖先。

也就是说，发现了“古菌”这种原本被认为是细菌的小小微生物。

因此，卡尔在生命起源树中引入了“域”概念，将三者分置成为一个“域”。

也就是古菌、细菌和真核生物三大域，这就是有根三域生命树，“根”则是那个三域共同的祖先。（1990年乌斯确定古菌域的两个门：‘广古菌门’和‘泉古菌门’后，结合其他学者的研究发现总结后，彻底区分古菌和细菌是不同的域，从而正式构建三域有根树）。

这里要提一下，三域树的根是在由日籍微生物学家IwabeMiyata（宫田岩部）和美籍生物学家J·Peter·Gogarten（J·皮特·高嘉顿）于1989年通过对不同种类的平行同源蛋白（Paralogous protein）分析得到的。

他们通过证古菌与真核生物蛋白质性质同源从而进一步证明了生命树的根部定位在细菌和真核生物-古菌共同祖先之间。

所以，三域有根树便在1990年开始，成为支持力度较大的一个假说。

这个假说中认为，真核生物和古菌、真细菌一样，有共同的进化祖先，是“兄弟”。

但我们还提到过“二域学说”。

这是和三域学说并排的，同样也是一种探究生命起源的假说理论，但也是有可能动摇三域学说的理论。

基因测序的发展，为人类探究生命起源提供了非常有力工具，在十九世纪八九十年代，催生出了大量对生命起源的研究。

像三域学说那样，二域学说也不是一个新理论。

在1984年，詹姆斯·莱克（James·Lake）基于核糖体结构类似性及进化简约性分类方法，揭示出，真核生物，很可能只是古菌进化出来的一个分支。

证据同样是mRNA测序项目进展带来的。

在1988年时，詹姆斯·莱克通过RNA测序，得出的证据有力的支持了二域学说，让他的学说有了确定的外群“根”，他的无根二域树也进化成了有根二域树。

他的研究表明，真核生物，很可能不是古菌的“兄弟”。

而是古菌的“儿子”。

古菌和真核生物的关系，是“父子”。

所以应该只存在两个域，古菌域和细菌域，真核生物只不过是一个分化子界。

三域有根生命树和二域有根生命树诞生时间近似，互相之间有很多研究发现是可以见证的。

随着基因测序工作进展和全世界的学者们的研究发现，在小小的细胞之中发掘出来的证据，时而偏向三域学说，时而又倒向二域学说。