遗憾的是，二宗主指使林霍恩暗中输入的指令已经奏效，大宗主成为了新宇宙蓝图中看不见的生命能量体，而且他错过了生命密码对接的时间，除非宇宙中出现空白垠，否则没有哪种能量能唤醒他。

白水钦根据他和妻子的基因蓝图，复制出新的库矩基因生命之源。暗中制造二源基因分裂事件，神不知鬼不觉地在那个星球开创了三源人世界。

然而，由于他女儿在整个自然界除了消失的大宗主，无法找到跟她生命完全匹配的密码，宇宙中不存在属于他女儿生命的能量源。

白水钦开始了漫长的基因改造之路，在生命轮回中不停地为芷熙寻找可替代的能量源，但每次都只能短暂地延长芷熙的生命。

直至有一天，白水钦终于测算出，自新宇宙诞生以来首个吻合度高达百分之九十九的源始能连接密码即将出现，空白垠即将形成，这是激活大宗主生命密码的最佳时机！

但是，如何让它跟女儿的密码对接呢？

白水钦在茫茫人海中锁定谷曼和齐达，因为他俩具有全宇宙独一无二的两人意能可完全融合的异能。

可是难题又出来了，女儿的生命延续不到她和大宗主生命密码对接的那一刻！因此，白水钦又把目光瞄准了昂星人科技……

一切都按原计划展开，尽管半路杀出神原教和晶体人，还有黑色梦行人的干扰以及狄奥连接空白垠之后的失控行为。最终空白垠还是激活了黑暗天体中的生命密码，芷熙也排除万难与大宗主相遇了！

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气泡内大宗主的生命密码在梦空间被梦行人芷熙唤醒，可是，在大宗主恢复原身之前，芷熙的真身却突然招回了自己的梦行人。

基因苏醒并恢复原身的大宗主，脱离气泡追寻到了吸附在转变舱外表的梦行人芷熙，在她完全失去能量补给的危急时刻，大宗主向芷熙施放了超能力。

“这一切终于结束了！”大宗主激动地通过暗幽物质向芷熙传递他的大脑意识。

“不知何时才有结束的一天！”芷熙也只需通过暗幽物质与他沟通。

“看来还真是，我们要摆平那些人，让全体库矩星基因苏醒……”

“还是先管眼前吧！”

“哦，对。可是我们无权破坏狄奥这种自然生成的源始能连接密码，但也不能让他肆意妄为，先让他飞去他的空白垠星涡吧！”

大宗主在芷熙面前启动真身分离程序，他周身泛起粼粼白光。